Структура

Инспекторат

Финансови контрольори

Дирекция Вътрешен одит

Дирекция Наблюдение, координация и контрол на дейността на Разплащателната агенция

Обща администрация

Дирекция Човешки ресурси

Дирекция Правни дейности и законодателство на Европейския съюз

Дирекция Финанси и управление на собствеността

Дирекция Стопански дейности, инвестиции и хидромелиорации

Дирекция Информационно и комуникационно обслужване

Дирекция Административно обслужване

Дирекция Връзки с обществеността и протокол

Дирекция Сигурност

Дирекция Обществени поръчки

Специализирана администрация

Главна дирекция Земеделие и регионална политика

Дирекция Поземлени отношения и комасация

Дирекция Търговски дружества и държавни предприятия

Дирекция Пазарни мерки и организации на производители

Дирекция Директни плащания

Дирекция Идентификация на земеделските парцели

Дирекция Анализ и стратегическо планиране

Дирекция Държавни помощи и регулации

Дирекция Европейска координация и международни отношения

Дирекция Развитие на селските райони

Дирекция Морско дело и рибарство

Дирекция Обща политика в областта на рибарството

Дирекция Политики по агрохранителната верига

Дирекция Растениевъдство

Дирекция Биологично производство

Дирекция Животновъдство